Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Skap2Q3UND0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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