Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms