Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFB2

Znhit6, Box C/D snoRNA protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit6Q3UFB2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znhit6Q3UFB2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znhit6Q3UFB2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms