Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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