Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf40Q3U319 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf40Q3U319 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf40Q3U319 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf40Q3U319 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf40Q3U319 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf40Q3U319 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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