Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf149Q3U2C5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms