Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms