Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrx1Q3TL44 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms