Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim71Q1PSW8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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