Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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ptchd1Q14B62 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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