Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp8b1Q148W0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms