Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim24Q0VG18 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim24Q0VG18 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms