Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc3h18Q0P678 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms