Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MitfQ08874 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MitfQ08874 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms