Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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