Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NrepQ07475 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms