Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms