Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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