Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a1Q04857 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms