Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd1Q03719 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms