Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms