Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms