Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nme2Q01768 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms