Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms