Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms