Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms