Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms