Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms