Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfaQ00731 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfaQ00731 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms