Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms