Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PgrQ00175 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PgrQ00175 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PgrQ00175 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PgrQ00175 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms