Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms