Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms