Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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