Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pkn1P70268 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms