Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NficP70255 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NficP70255 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NficP70255 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms