Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chl1P70232 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms