Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms