Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4bP68372 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms