Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vsnl1P62761 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vsnl1P62761 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms