Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmc1P62192 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmc1P62192 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmc1P62192 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms