Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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