Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps5P59438 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms