Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms