Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms