Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms