Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp5P56399 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms