Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp1P55194 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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