Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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NcanP55066 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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NcanP55066 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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