Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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